Nach dem Abitur erhielt Henner Eppel seine künstlerische Ausbildung von 1966 bis 1971 an der Musikhochschule in Frankfurt am Main bei Prof. Werner Richter, die er mit dem Konzertexamen abschloss. Es folgten Privatstudien bei Peter-Lukas Graf in Basel. Nach einem Engagement in Würzburg war Henner Eppel von 1974 - 1994 Solo-Flötist des „Philharmonischen Orchesters Heidelberg“. Zahlreiche Konzertverpflichtungen als Kammermusiker und Solist führten ihn u.a. ins europäische Ausland sowie nach den USA, Ägypten und Japan. Dabei spielte er Werke aller Musikepochen mit Schwerpunkten Romantik und Musik des 20. Jahrhunderts.1971 begann er seine Lehrtätigkeit: zunächst am Staatskonservatorium Würzburg, dann an der Würzburger Musikhochschule, der Musikhochschule Mannheim/Heidelberg und der Musikhochschule Frankfurt am Main. Seit 1994 ist Henner Eppel Professor an der Frankfurter Musikhochschule http://www.hfmdk-frankfurt.de – er leitet eine Flötenklasse und ist für den Bereich Didaktik und Methodik des Flötenspiels zuständig.
Bei einem bekannten deutschen Musikverlag http://www.zimmermann-frankfurt.de ist er als Herausgeber tätig, wobei die Schwerpunkte auf der Wiederveröffentlichung romantischer Flötenmusik und Kammermusik für Flöte liegen. Mittlerweile gibt es mehr als 50 Ausgaben, die von ihm betreut wurden.Auf zahlreichen Kursen konnte er seine große Erfahrung als Lehrer und Spieler weitergeben.